Ne samo, da uporaba vlažilcev zraka povzroči bolezni dihal, ampak tudi nepravilna uporaba vlažilcev lahko povzroči bolezni dihal.
Na primer, vlažilec ni pravočasno očiščen, kar absorbira in razmnožuje bakterije in viruse, nato pa skozi vlažilec postane vodna meglica, ki vsebuje bakterije, ki se vdihnejo v dihalne poti in povzročijo različne bolezni dihal;
Predolg čas vlaženja bo povzročil visoko vlažnost zraka, bakterije in virusi v zraku pa bodo z dihanjem vstopili v pljuča, kar bo povzročilo respiratorne simptome;
Kakovost vode v vlažilniku je slaba, vodna meglica z bakterijami, ki nastajajo skozi vlažilnik, se vdihava v pljuča, kar povzroča vrsto bolezni dihal.
Poleg tega bo uporaba vode iz pipe pri uporabi vlažilnika povzročila tudi prekomerno razmnoževanje bakterij. Pri uporabi vlažilnika priporočamo uporabo prečiščene vode.